案件并不复杂，图书馆的馆长在书里藏毒被职员玉田和男发现，然后馆长就杀人灭口了，并将尸体藏到了电梯箱的顶棚上面，这导致柯南一直闻得到尸臭味，但却找不到尸体。

白天的时候，目暮警官的到来让少年侦探团几人兴奋了起来，非闹着要查清这起案件。

柯南原本是拒绝的，但是他已经很久没独自查案了，只要和羽生清安在一起，他就没机会，所以一时手痒之下，就同意了。

事情倒是很顺利，他们几个小鬼头藏在清洁间的柜子里，一直到天黑之后，所有人都离开了图书馆，这才出来。

结果正好发现了图书馆的馆长在从一箱书里往外掏东西，柯南马上认出是毒，动机清楚了，接下来就是尸体的位置。

这也不难，柯南想起他们几个今天乘坐电梯时竟然超重了，但是明明当时电梯里的人并没有达到超重的界限，所以就想到可能是在电梯顶上了。

然后，他们就开始被追杀了……

图书馆的电话打不出去，柯南的手机又放在了阿笠博士那里维护升级，无奈之下，只好掏出御守叫人。

羽生清安叫雪女上来的时候，他们正被凶手追得在走廊里到处跑，结果除柯南外的所有人，包括凶手在内，同时被忽然冒出的式神吓了一跳。

“所以，那位大哥哥是阴阳师？”步美不是很理解阴阳师的意思，但大概明白是可以驱鬼的人了。

她跑到羽生清安面前，一脸好奇地打量着，然后问道：

“大哥哥，我发现了一个有鬼的别墅，你可以帮忙一起去驱鬼吗？”