面对着亚历山大率领的伙伴骑兵，波斯大王身边的将士很快便非死即伤，就连他的马匹也开始不听使唤。若不是他的兄弟欧克塞斯里斯进行了一次冲锋使他能够从战斗中逃脱，这位波斯大王很快也会成为一位牺牲者。大流士就好像是面对着发怒的赫拉克勒斯和阿喀琉斯一般，被恐惧的暴风所席卷，丧失了一切英雄气概。

大流士看到自己的左翼已经被击溃，亚历山大也已经插进了己方军队与阿马努斯门之间，自己更是面临着被俘甚至阵亡的危险。这位波斯大王失去了所有自制力，迅速逃到了一辆专门为他准备的、由备用战马拉着的轻便战车上逃亡了。但由于地形崎岖，而且遍布着逃兵，这辆战车也没有把他带走太远。好在大流士早已备下一匹良种母马，为了给逃命做准备，波斯人甚至还专门将这匹母马生下的小马驹留在了阿马努斯门。乘战车逃亡不久之后，大流士便换乘到这匹母马上从战场上奔驰而去。随着国王在众目睽睽之下逃跑，波斯左翼和中央的部队立刻便丧失了一切纪律。正准备前进投入战斗的第二线预备队也立刻便像融化一样步大流士后尘而逃。马其顿极右翼的配奥尼亚人、弓箭手、阿吉里亚人、佣兵以及两个骑兵中队发动追击，杀死了所有没能及时逃亡的波斯人。已经取得优势的波斯右翼骑兵发觉了左翼的溃败，而且很快便听到了“国王逃跑了！”的悲鸣。他们立刻便失去了勇气，开始动摇，在认清自己无论如何奋战也无法取胜之后便同样掉头逃跑了。色萨利骑兵紧跟在后-进行追击，不仅杀死了大量这些骑兵，甚至还导致波斯骑兵之间互相践踏。-=

在发动全面追击之前，亚历山大必须先确保左翼和中央的安全，再加上夜晚临近，他也无法追得太远。这两个原因使大流士本人得以逃亡，不过亚历山大还是俘获了他的战车（大流士的米底披风也留在车中）、弓箭以及盾牌。大流士则一直逃到了幼发拉底河，并从塔普萨卡斯渡到河流[]对岸之后才停止逃跑。从这支大军的残骸之中，他仅收集到了4000名希腊佣兵。所有没被杀死的波斯步兵都逃到了山区中，骑兵则一路沿着海岸逃亡，最终逃过了上阿马努斯隘口。据说还有一支8000人的希腊佣兵在安提约古斯之子阿明塔斯带领下向南沿海岸杀出重围逃到了腓尼基，从莱斯博斯人那里夺取了船只，在烧掉不需要的那部分船之后驶往塞浦路斯，之后又逃亡到埃及。与阿明塔斯一同逃亡的还有门托耳之子锡蒙达斯、法勒斯人阿里斯托德墨斯（aristodemusofphares）、阿卡纳尼亚人比阿诺尔以及其他一些逃亡者。

在格拉尼卡斯会战中逃得性命的阿萨米斯、罗米色瑞斯在伊苏斯会战中阵亡。波斯人被杀者极多，按照原来的历史，数量达到了10万人，其中还包括10000名骑兵。拉古斯之子托勒密声称自己手下士兵在追击时曾将死去的敌人扔进沟壑中堆成桥梁跨越而过。

而这一次，李宁的加入让事情有了很多改变。

按照皇帝赵祯的想法，李宁只需要等在敌人撤退的路上，然后捡个巨大的便宜就行。

但是，这个便宜之大，实在是超出正常人的想象。

首先窥探了波特战线无法组织起有效的进攻，当他们在逃跑的路上碰到斜刺里杀出的李宁之后，几乎毫无防备地陷入了更大的混乱和惨烈的互相踩踏之中。

其次，波斯剑里面的勇敢习惯性地发挥在了战场上，当他们如同王鑫那般英勇的冲向亚历山大的时候，没有想到对方的果断远远超过了他们的想象，于是他们的生命被这样浪费在了之前的战场上，而在那之后，当他们的士兵遇到李宁的时候，这些原本可以指挥士兵的人已经荡然无存，所以更加无序和混乱夺走了越来越多波斯人的生命。

而更为致命的是亚历山大通过东线战场所取得的优势，在这个时候也发挥了类似的作用，双方几乎是通过两面夹击的方式，驱赶着波斯人在奔逃。

因此这一路上双方所取得的战绩都是十分辉煌的。