原来轩辕剑真正诞生的时代并不是黄帝的时代，而是比黄帝更早的洪荒时代，换算一下距今已经有几百万年的时光了。据轩辕剑所说，她本是盘古斧的斧刃，然后盘古斧化为洪荒三大神器，她这个斧刃却没有这么幸运，无法变化成新的先天至宝，最后被妖皇帝俊给收入宝库之中。

当时天地间的主角是巫族和妖族，人族仅仅只是女蜗刚刚照出来的一个不起眼的小种族罢了，在妖族和巫族的眼中是连食物也算不上的种族。只不过因为是女蜗娘娘成就圣人的依凭，所以并没有妖族和巫族也没有刻意对付人族。

当时妖族和巫族为了争夺天地间唯一的主角而战斗不休，其中十二祖巫的力量作为继承了盘古血肉的存在，力量极其强大，同时身体表面的防御能力极为恐怖，按照轩辕剑的说话，就算是仙剑级剑娘也攻击也很难突破十二祖巫的防御。所以每每和十二祖巫真正开战的时候，最后落败的往往都是妖族，因为妖族的顶尖战力根本不是巫族的对手。

后来为了诛杀巫族，妖族便将盘古斧的斧刃给取了出来，有各种珍贵至极的材料，锻造出了一把能够能够轻而易举的割开祖巫血肉的神器，也就是斩巫剑。

后来在妖族和巫族的决战之中，帝俊将斩巫剑作为最后的秘密底牌亮了出来，果然大展神威，一举击杀了巫族之中的两大祖巫。

失去了两位祖巫之后，巫族的顶尖力量已经不是妖族的对手，力量的天平开始反转过来，妖族开始全方位向巫族发动进攻，巫族则节节败退，眼瞅着巫族就要彻底失败的时候，巫族也亮出了自己的底牌，那就是十二都天神煞大阵。

在十二都天神煞大阵的威力之下，妖族损失惨重，十大妖圣都阵亡了很多，但巫族也有自己的破绽，为了组成十二都天神煞大阵，剩余的十个祖巫不得不使用自己的精血硬生生的将两个大巫给推到了祖巫的境界，结果这两个祖巫并不稳定，在战斗的后期这两个祖巫直接退回了大巫的境界之中。

这让妖族看到了希望，于是两大种族展开了一场漫无天日延年了上千年的战斗，最终十一个祖巫阵亡，帝俊和太一也和祖巫同归于尽，只有这斩巫剑最后落在了人族的地盘，被公孙轩辕的祖先给捡走，当做他部落的神器供奉起来。