伏见宫贞爱的第四旅团在南投城下兵败，一路狂退到彰化，乃至台中的消息传到云林城下的乃木希典，他再也按捺不住，命令全军回师嘉义，但也正是这个决定，令第二师团的崩溃成为不可扭转的趋势。

夺下嘉义的萧奈根本就没打算往北攻击第二师团的后翼，为了占稳脚跟，搜刮日军遗留下来的军事物资，他的二团基本全员动员在全城范围之内挨家挨户地进行搜索，甚至还感到人手不足，捉襟见肘，也由此他扩编了三团，麾下的军队空前壮大。

与他预料的一模一样，没多久乃木希典的第二师团便陆续南下向嘉义城发起攻击，但他守株待兔，养精蓄锐，根本不与日军在城外决战，死守城内，并不断派出十余股以连级为单位的袭侵队，对南下的第二师团各路部队进行袭击，将日军折腾得精疲力竭，毫无办法。

乃木希典在嘉义城下折腾了一天毫无任何的进展，而逃兵越来越多，最后甚至出现部队哗变的状态，一个小队一个小队开始自行撤离战场，向海边逃去，沿路不断遭遇到萧奈袭侵队的攻击，损失惨重，但这依然没有阻止日军全面败逃的趋势。

“呀叽给给，呀叽给给！”乃木希典亲自在嘉义城下的阵前，狂热地挥舞着指挥刀，使劲地驱赶士兵们向城墙冲锋，他甚至将反应稍慢，动作迟缓的士兵当场砍翻在地，但日军的厌战情绪已经像瘟疫一般在全军上下弥漫，越来越多的士兵选择临阵逃亡，而他的周围铺倒了一层层被他击毙或是砍死的所谓逃兵尸体。

萧奈在城楼上用望远镜看到这一幕景象，便知道第二师团的败局已定，乃木希典的大势已去，在命令炮兵连朝乃木希典前指位置进行覆盖性轰击之后，便命令城内的红标军发起对日军全面的冲击。

当密密麻麻仿若汪洋大海一般的人群端着刺刀从城内冲出来，眨眼间便像潮水一般淹没日军出发阵地时，所有人都知道这一战日军彻底失败了。

刚开始日军还能顽强地抵抗冲来的红标军，用刺刀与他们厮杀成一团，但越来越多的红标军加入战团，日军再也无法抵御，无论军官们如何命令坚守也无法阻止全军的败退，甚至连督战队也选择逃跑。

萧奈亲自带队杀出城外，在堆尸如山的日军阵地上反复寻找，却没有寻到乃木希典的尸体，而俘获的几百名日军战俘中却也没有发现乃木希典的身影，这让他极为恼怒，为了获寻乃木希典的下落，他一次性就斩杀了一百多名日军俘虏，最终得到了乃木希典逃向嘉义城西南方的布袋港的消息，他立刻命令二团挥师布袋港，尾随着落败的日军，无论乃木希典逃到天涯海角，也要将其击毙。