章惇仇恨之心如此之重，恨不得将元祐大臣全部消灭。1094年，章惇为相，便开始收拾苏轼了，贬其到岭南。岭南彼时为蛮荒之地，瘴气盛行，语言殊异，尚无人给贬到这么远，此时苏轼已经57岁。苏轼在惠州，曾做诗“为报诗人春睡足，道人轻打五更钟”。这首诗传到首都，章惇一看，这苏轼活得挺舒服啊，就特不高兴，再贬苏轼到海南。

有宋一代，别说当官的不愿意去海南，就连大陆的老百姓都不愿意去，过海峡，遇黎人，都不太好弄。苏轼字子瞻，谪儋州，以瞻与儋字相近；苏辙字子由，谪雷州，以雷字下有田字；黄庭坚字鲁直，谪宜州，以宜字与直字相类。据说这些都是章惇的主意，拿这些有文化的人开涮，让他们受心理上的奇耻大辱。不过苏东坡这人倒是道行深厚，在海南住茅屋，还写下了这样的诗，“九死南荒吾不悔，兹游奇绝冠平生”，生活中失败了，但还是登上心理的制高点，谁拿他也没招儿。

哲宗24岁时就死了，新皇太后摄政，又开始赦免元祐大臣，苏轼被批准返回大陆。苏轼原以为可能就死在海南了，真没想到还有平反的这天。很快，宋徽宗即位，章惇又失势了，这回也给贬到雷州。苏轼北归，一路受到热情的款待，有人是他朋友，有人慕其文名，路经靖江的时候，许多文人朋友都来拜见他，章惇的儿子章援没来。当年苏东坡作主考官，亲自第一名录取章援，按照当时的传统，章援当为苏轼之门生。章援感觉到苏轼可能会再次当政，就怕苏轼以其父之道报复，于是给苏东坡写了一封信，很委婉，意思是说辅佐君王的人，一言之微，足以决定他人之命运。

苏轼给章援回信了，这样写的：某与丞相定交四十余年，虽中间出处稍异，交情固无增损也。闻其高年寄迹海隅，此怀可知。但以往者更说何益？惟论其未然者而已。……，书至此，困惫放笔，太息而已。（1101年）六月十四日。

同年苏轼病故。1105年章惇卒。

宋徽宗能当上皇帝，第一个原因就是他的皇兄哲宗死后无子。哲宗和徽宗就是北宋的第七、第八代皇帝，是兄弟俩。他们的父亲，是北宋的第六代皇帝宋神宗。神宗一共有十四个儿子，但是从老大到老五，及老七、老八、老十这八个儿子全都夭折了，只留下六个长成年的皇子，哲宗是第六子，徽宗是第十一子。

哲宗归天，又没有儿子，那么到底由五个弟弟里面的哪个来承继大统呢？当时的太后，也就是神宗的皇后向氏，就召集百官来商量这事。向氏在徽宗承继大统这件事上，起了非常关键的作用。向太后本人并没有亲生的儿子，哲宗也不是她生的，所以哲宗下面这五个弟弟谁来继统，在她眼里是无所谓的。向太后隔着帘子问大臣：“大行皇帝归天，没有子嗣，诸位爱卿，你们看谁来继统？”这个时候，给宋徽宗帮忙的人出现了，他就是宰相章惇。当然，这并不是章惇的本意，可是他的话却阴差阳错帮了宋徽宗大忙。

章惇这个人，年轻的时候跟大文豪苏东坡关系很好。有一次，两个人出去游玩，到了一条水流很急的溪边，溪上有一座独木桥，对面是一座峭壁。章惇就对苏轼说，老苏，咱俩过去在峭壁上题诗怎么样？苏东坡一看太危险了，说我不去。章惇却若无其事地沿着独木桥走到溪流对面，把长袍往腰带上一掖，拽着老藤就荡到峭壁跟前，提起笔来写上“苏轼章惇游此”，就是到此一游的意思。章惇回来后，苏轼看了他一眼说，你要是掌了权，肯定是个杀人不眨眼的家伙，会有千百万人头落地。章惇问为什么，苏轼说，你连自己的命都不当回事，能拿别人的命当回事吗？果然，章惇做了宰相之后，将党同伐异、驱逐异己的手段用到了极致，就连当年块题诗的老朋友苏轼，都没逃过被流放的厄运。

向太后问众位大臣谁能继统，章惇作为宰相，当然应该第一个发言。他张嘴就说：“母以子贵，如果继统的话，应立先帝同母弟简王。”也就是说，应该立跟先帝同一个妈生的第十三子简王。他这句话一说完，太后的脸色马上就变了。虽然隔着帘子章惇可能看不到，但是他也马上明白这话说得太鲁莽了。果然，太后隔帘就发问：“宰相你说的这叫什么话，什么叫同母弟啊，这六个皇子难道不都是哀家的儿子吗？”这下宰相就傻了。