无辜的李由也受到了父亲的牵连，他被削去三川郡守一职。不过由于前方战事紧急，他没有被立即下狱，而是被发配到了雍丘继续与楚军作战。怀着戴罪立功的心态，李由来到了雍丘，他希望以自己的战功能为父亲洗刷冤屈。为了父亲，为了整个家族，李由带着必死的决心再次坚守城池。

李由虽是个官二代，却并不像纨绔子弟那样。从小父亲就给予他最严格的教育，绝不允许他仗着丞相的威风胡作非为。李由回想起父亲总是处处谨小慎微，就这样在凶险的秦国官场中，一路如履薄冰般地走过来。

记得有一次，李由从三川郡回家省亲，父亲宴请宾客，当时咸阳城内有身份的文武百官纷纷前来拜会。正当所有人开怀畅饮的时候，李由突然察觉到父亲隐隐有一种怅然若失的表情。他主动上前询问父亲安好，只听见李斯叹了一口气，说道：

“我的老师荀子曾经说过‘物禁大盛’。我李斯本是上蔡的一介布衣，街巷里的一个普通百姓。先皇不嫌弃我身份卑微，将我提拔到这样高的职位上来。在当今所有臣子中，没有人比我的地位更高了，可以说是荣华富贵达到了极致。然而物极则衰，我真不知道这样下去的结果会是怎样啊？”

“物禁大盛。”李由喃喃自语，现在他终于理解父亲所担心的是什么了。

李由仍不甘心，他不想就这么输了，他觉得战功是唯一可以帮助父亲洗刷冤屈的办法。

被逼到绝境的李由置之死地而后生，他斗志昂扬，身先士卒，率领着雍丘守军与楚军激战。然而李由的运气实在太差了，如今他的对手早已不是当初的陈胜和吴广，而是升级到2版本的项羽和刘邦。与陈胜和吴广相比，项刘二人的战斗力有了很大的提升。他们刚刚联手屠戮了襄邑和城阳，现在兵锋正盛。

在雍丘之战中，刘邦军状态神勇，气势如虹。但见城头上刀光剑影，血肉横飞，惨叫声不断，厮杀声不息。樊哙率领敢死队第一个攀上城墙，他一人连续斩杀十六人，拔得头筹；而在城墙下，战车隆隆，烟雾弥漫。夏侯婴率领战车兵团顶着敌人的箭雨冲锋陷阵，立下赫赫战功；而这次战功最大的，当属骑兵部队的曹参。

曹参一开始骑着马在城外巡视，寻找雍丘城的突破口。第一波攻城战他的军队没有参与，反倒是樊哙领衔的步兵占了先。城破之后，楚军步兵一股脑地向位于城中制高点的秦军指挥部奔去，大家都认为那里一定会有大鱼。而曹参率领着一支骑兵部队，兜兜转转来到了西城门，他准备守株待兔，等待西逃秦兵。

果然，他在这里撞见了负隅顽抗的李由。

雍丘城破后，李由左臂中箭，血流如注。他率领守城将士撤出指挥部，与楚军展开了顽强的巷战。李由单手执剑，接连砍杀数十名敌人，他与最后仅剩的十几名贴身卫士且战且退。无奈敌人愈杀愈多，如同蚂蚁一般蜂拥而至。李由就像一头雄狮，困兽犹斗，依然坚定地捍卫着自己的领地和尊严。

李由一行人战至西城门，已是精疲力竭。这时，一直在城外打游击的曹参率领着大队骑兵突然出现。来得早不如来得巧，成功的时机很重要。还没有任何战功的曹参就像看到猎物的饿狼，立刻打起了精神，立功的时间到了！这伙骑兵便策马扬鞭，一举冲破了秦军的防守队形。战马如同重锤一般撞入人群，顷刻之间，一片狼藉。失去了阵型保护的秦兵如同待宰的羔羊，李由也在混战之中被曹参刺杀。

李由死了，殷红的血迹染透了战袍。他手握长剑，死不瞑目，他的尸体屹立不倒，仿佛至死还在反抗着命运的不公。如此壮烈的场面让他的敌人不由得肃然起敬。

同样年轻的楚军将领项羽，此时也赶到了西城门，他见到这般惨烈的战况，也唏嘘不已。英雄之间，惺惺相惜，李由的壮烈牺牲终于赢得了对手的尊敬。这次项羽没有再屠城，而是将李由的尸体礼送回其老家上蔡（今河南驻马店市上蔡县，予以厚葬。

李由的死虽然赢得了楚国的尊重，在秦国却遭受到来自上层的打压。赵高再次向办理李由通敌案件的特使施加压力，要求他们务必查出李由通敌的罪证。

负责督案的使者王明和陈宗，是两个正直的大臣。他们在了解李由英勇战斗的事迹后，大为感动。这二人顶住巨大的政治压力，据实上奏：

“臣等奉旨查办李由通敌案。雍丘一战，李由不以履险而却，不以临危而避，舍生取义，忠烈可风！”

然而王明和陈宗的仗义执言，没有传到秦二世的耳朵里，报告又被扣押在赵高的手中。李由的死并没有换来整个家族的平安，不久，赵高便将李家全部逮捕。赵高用严刑峻法惩治李斯，这位当朝丞相前前后后被打了一千大板，体无完肤。

遭遇了不白之冤的李斯认为自己对秦朝有立国之功，他不服气，于是在狱中继续上书鸣冤：

“臣为丞相，治民三十余年矣。逮秦之地陕隘。先王之时秦地不过千里，兵数十万。臣尽薄材，谨奉法令，阴行谋臣，资之金玉，使游说诸侯，阴修甲兵，饰政教，官斗士，尊功臣，盛其爵禄，故终以胁韩弱魏，破燕、赵，夷齐、楚，卒兼六国，虏其王，立秦为天子。罪一矣。