今文经认为：解释经义主要在于通经致用，在研究方法上今文经学家主张章句推演，结合春秋战国时期的阴阳五行和刑名学说来发挥微言大义，主张君权神授、大一统、三纲五常的思想。其实后世流传下来的今文经，在很大程度上是受董仲舒的新儒学的影响。是经过董仲舒改良之后逐渐演变而来的。

古文经认为：重视研究古代的典章制度，在分析事物发展演变时不结合阴阳五行和刑名学说。注重师承、严守家法。在研究方法方面古文经学家看中的是章句训诂，把儒家经典视为古代的历史资料，简单来说就是把儒家经典看作历史书。并没有把儒家经典上升到神圣不可侵犯的高度。因此在总体上来看古文经相比今文经来说显现出一定的保守性。

3、对待孔子的态度不同：

两者除了研究方法的不同之外，在对待孔子的态度方面也有很大的不同。这种不同主要体现在对孔子的评价：

今文经学家认为孔子是素王，六经都是孔子创作出来的。而且孔子是现行的很多制度的创立者。孔子并不是儒家文化的传承者而是儒家文化的创立者。因此今文经学家是把孔子作为儒家的开山鼻祖身份来加以评价的。

古文经学家认为孔子是先师，孔子的一套理论体系是从周公那里传承而来的，他的主要特点就是传而不述。因此古文经学家是把孔子作为儒家文化传承者的身份来加以评价的。

二、两汉时期——今古文之争的巅峰期。

两汉时期是今古文经之争的第一个高峰时期。这场斗争从西汉初年在孔子旧宅和河间王处发现古文经为起点，到东汉末年经学大师马融、郑玄结合今文经和古文经遍注群经实现两者初步融合为终点。整整贯穿两汉四百多年的时间。在这一时期，今文经和古文经既有斗争又有融合，最终实现了同一发展。以下是两者斗争的主要几个阶段：

1阶段一：（西汉初年今文经占有优势。

西汉初年，因为今文经出现较早。而且董仲舒等人也以善治今文经《公羊春秋》得到汉武帝的赏识。在董仲舒的建议之下，汉武帝确立了把儒家思想作为统治思想的政策。提出了“罢黜百家，独尊儒术”的方针。但是，这里汉武帝强调的“儒术”是今文经而不是古文经。在董仲舒的建议之下很多今文经学作品陆续被立为学官。