三边总督萧大亨在闻知有大量流民作乱后才查知内情，而因此派人快骑报于了朝廷知道。

在萧大亨报此事的同时，广西道御史其实已提前向朱翊钧奏禀了此事，且直接上疏参劾申时行说：

“元辅申时行为积财于私党，不思赈济，不准地方有司报忧而只令其擅行苛政，以至于得罪菩萨，天降大旱，先是广西饥，后是淮扬地震，数县百姓无家可归，如今凤翔又大饥，去冬京畿亦雨雪不时，灾异频见，咎当在此。”

“故请陛下停其苛政，罢其职，早令有司赈济，而熄天怒！”

而左副都御史张岳也向朱翊钧奏明了地方上许多官吏过度执行的问题，且言道：

“延安府同知石巍强毁寺庵，致使上万百姓无家可归，落草为寇，真宁知县刘衢索贿大户，若不从，诬其宅邸为私庵而毁，一时激起民变，竟致真宁为贼寇所据，而有司不敢奏，怕为权臣不喜！”

朱翊钧则将这些章奏直接下到了内阁，让申时行自己票拟。

申时行则因此特地请了时任光禄寺卿的凤翔人李辙问：“凤翔去年大旱刚起时，仆便票拟得旨，令地方准备赈灾，若钱粮不足，可请朝廷拨款调粮以赈，为何如今竟还大饥？”

李辙道：“恩辅乃南人，虽也是仕宦之族，但却是居于城镇之乡宦，不知我们北方地方实情，在我们北方，赈灾全靠地方乡绅，因为官员大多居于城市为奸吏所隔，而除非真的不遵官员不得随便下乡的祖制，否则地方灾变只能看乡绅解决。”

“何况大多数官员多本不愿意下乡，查问民情，只积极于钻营与媚上，好一点的也只是追求清静无为，既不媚上钻营也不查问民情。”

“所以，大饥表面上看地方官不恤民情所致，但实际上是地方乡绅故意为难官府所致。”

“他们不先出粮赈济，反而会提前囤积居奇，又勾结胥吏烧毁常平仓，所以就导致官府哪怕在城郭附近也出现灾民进而知道灾变时，想赈也无能为力，乡绅也不赈济乡民，反会唆使寄居于寺庵苟活的百姓造反！”

“这一切明面上是天灾，实际上是人祸，而有此人祸就是冲您这清理佛寺之政来的。”

李辙说后，申时行就叹了一口气：“仆还是把改革想简单了！”